本智慧晶片系統與應用領域PBL課程的學習重點在於以生物資訊學以及IC設計領域為重要議題，目標應用主題為次世代基因定序資料分析。下圖為當今DNA次世代定序後至實際應用場域的流程，當收集完目標個體之DNA樣本後，會經過定序儀進行次世代基因定序，得出的輸出資料會再借助生物資訊學中的基因資料分析演算法進行分析與統計。最後彙整出醫療、研究人員可解讀格式並可應用至精準醫療、判定罕見遺傳疾病、分析家族基因史等。

課程的教材之授課對象主要為大學部三、四年級學生。規劃三周總共課程時數6個小時的課程，修課人數預計總共20至30人左右，專題作品10件，實際課程內容與規劃如下，會先介紹領域背景相關知識和核心演算法，再開始分別在第二與第三周進行實驗一與二，以軟體和硬體分別實現基因資料分析的步驟，加速整個應用流程，並且最後比較差異、引導學生學習如何在跨領域中解決問題、尋找答案。